三匹の猿の科学者が宇宙船で地球に到着する。テイラー大佐の帰還だと思って迎えに出た軍関係者は、ヘルメットを取った猿を見て唖然とする。期待と驚きの落差がシュールな笑いをもたらすのである。三匹の猿は動物園での事故で二匹になった。コーネリアスとジーラの夫婦である。ジーラは子供を身籠もっている。
VIPとして遇されていた彼ら来訪者もやがて人類の敵と見做されるようになる。未来の地球について、彼らから聞き出した衝撃の事実を深刻に受け止めた当局は、今のうちに厄災の種を消し去ろうとするのである。逃げ出したコーネリアスとジーラを銃撃班が追い詰める。動物学者のルイス博士らがなんとか助けようとするが哀れコーネリアスとジーラは銃弾を受け息絶えるのである。
